当您还款时发现借条丢失，可以采取以下措施来处理：
您可以要求出借人在书写的收条中注明借条因丢失而未归还给借款者，并写明债务关系因还款已经终结。这样既可以避免后期被再次要求还款，又能为还款行为提供直接证据。
除了收条外，您还可以收集其他证据来证明债权债务关系已经消灭，例如录音录像、银行取款凭证、转帐凭证、双方往来的短信、留言等。这些证据只要不违反法律规定和社会公德，都可以作为合法的证据使用。
如果可能的话，您可以要求出借人在还款时当场销毁借条，或者由出借人返还给借款人。如果对方不销毁，您可以要求其出具其他书面还款证明，并固定这些证据，以防止后期出现纠纷。
您可以与出借人协商，要求其签订还款计划或协议。在签订协议时，可以注明原借条已丢失，并详细列明还款的金额、时间和方式等。这样即使借条丢失，也能有法律依据来证明还款事实。
无论采取哪种方式还款，您都应该妥善保存所有相关的证据，包括收条、转账记录、协议等。这些证据在日后可能出现的纠纷中将起到关键作用。
根据《民法典》的规定，请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，在采取上述措施的同时，您还需要注意诉讼时效的问题，确保在时效期内采取法律行动。
通过以上措施，即使借条丢失，您也能有效地证明已经完成了还款，从而避免后期可能出现的法律纠纷。
