离婚后处理两限房的方法如下：
离婚时，两限房首先应由男女双方协商分割。如果双方能够达成协议，可以签订离婚协议，并依照协议内容进行财产分割。
如果协商不成，双方无法就两限房的分割达成一致意见，则可以向人民法院提起诉讼，由法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。
对于一方在婚前申请，另一方在婚后用个人财产支付首付的两限房，应认定为该方的个人财产，不属于夫妻共同财产，但婚后共同还贷部分及其对应的增值部分应视为夫妻共同财产，需要进行分割。
如果两限房是婚后以夫妻两人名义申请的，并且以夫妻共同财产支付房屋价款，那么该房产应认定为夫妻共同财产，离婚时应进行分割。
离婚后两限房的过户需要携带相关证件，包括离婚证、身份证明、房地产登记申请书、地产证及相关委托书等，并到公证处办理析产公证，然后到交易中心办理转绘，最后到房管局办理免征契税申请、析产登记手续并缴交登记费，取证。
如果两限房购买不满5年，法院可能会剥离该房产，告知当事人待其上市交易时另行提起离婚后的财产纠纷诉讼。如果已满5年且为夫妻双方共同申请，则以普通房产处理方式进行分割。若房产为一方婚前申请并贷款购买，则该房产属于该方个人财产，但婚后共同还贷部分及其增值部分应予以分割。
建议：
在处理离婚两限房时，建议首先尝试协商，如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
由于两限房具有福利性质，其分割可能涉及复杂的法律问题，建议在专业律师的指导下进行。
